本课题组的重要研究方向之一是拉曼光谱在临床病原微生物中的快速检测研究。由细菌病原体引起的传染病是重要的公共问题。此外，由于抗生素的过度使用，在临床环境中广泛遇到了许多多重耐药的细菌病原体。因此，细菌病原体的快速识别和抗生素耐药性分析可以极大地促进传染病的精确治疗策略。迄今为止，已经开发了许多用于体外诊断的常规和分子方法，无论是手动还是自动化，都已被证明是准确、可靠和省时的。尽管拉曼光谱是地球化学和材料科学等各个领域的成熟技术，但它仍然被认为是传染病研究和诊断的新兴工具。根据目前的研究，现在说拉曼光谱可以为微生物学家和临床医生提供实用指南还为时过早，因为基础研究和临床实施之间仍然存在差距。然而，由于在几个单一步骤中无标记检测和无创识别细菌感染和抗生素耐药性的前景广阔，因此，有必要对其进行深入研究。该技术的临床应用以及如何解决当前实际应用中面临的障碍是本课题的研究重点。

在健康小鼠中已发现糖原分子结构的昼夜变化。最近在大肠杆菌中发现了脆性(在二甲基亚砜中解体)和稳定(在二甲基亚砜中不解体)糖原颗粒。然而，大肠杆菌中糖原结构是如何动态变化的还不清楚。这里研究的问题是，细菌中是否存在脆弱而稳定的糖原α颗粒，其模式与小鼠相似。在本研究中，我们利用透射电子显微镜、大小排阻层析和荧光团辅助碳水化合物电泳技术，研究了大肠杆菌BL21(DE3)在24小时内糖原分子结构的动态变化。研究发现，糖原结构在合成阶段以脆性为主，在降解阶段基本稳定。定量逆转录聚合酶链反应结果表明，糖原代谢中合成代谢和分解代谢基因表达水平的平衡可能是影响细菌糖原α颗粒脆性的关键因素。 论文官方网址请点击下方链接： https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0144861721001600

先前对一小部分GBE的进化分析表明，可能存在两种类型的GBE。这是基于他们的N端域组织。N-末端是位于形成蛋白质的多肽链起始处的胺基。第一种类型的GBE(类型1)同时具有N1和N2结构域，而第二种GBE类型(类型2)仅具有N2结构域。研究人员最初使用隐马尔可夫模型分析了169个人工审查的细菌GBE的N-末端结构域。在概率论中，马尔可夫模型用于对随机变化的系统建模。当状态部分可观察时，使用隐马尔可夫模型。系统发育分析发现，某些细菌门(界以下或界以上的生物分类水平)的GBE类型聚集型。这一分析表明，较短的2型GBE主要出现在革兰氏阳性物种中，而较长的1型GBE主要出现在革兰氏阴性物种中。革兰氏阳性和革兰氏阴性描述了细菌外层的差异。革兰氏阳性细菌有厚厚的肽聚糖层，可以吸收周围的物质，而革兰氏阴性细菌有多层薄膜层，可以排泄毒素。有趣的是，这项研究还发现了之前没有报道的第三组GBE(类型3)。这些3型GBE在其N1结构域之前大约有100个氨基酸。 论文官方网址请点击下方链接： https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2018.03354/ful